Да уж тут есть два выхода, причем выбирать будет, тяжело и возможно появится третий.
Во-первых, можно попробовать реализовать те возможности которых тебе не хватает сейчас: поменять магнитолу с возможностью чтения карт памяти и линейными выходами для сабуфера; поставить сабуфер+ к нему усилок+ проводку вести к нему в багажник.
Во-вторых, ты можешь в процессе переделки решиться и на более кардинальные меры, добавить к сабу и магнитоле хорошую компонетную акустику, вместо штатной и усилок для неё, ну и до бесконечности в таком варианте событий…
И, в-третьих, посчитав свои расходы, можешь и ничего не менять

.